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March 11, 2010

[rice-net] 【急募】研究員の募集

10.3.9 10:51 PMより転載

 

株式会社トラスト・テックの松田と申します。

弊社では現在、以下の要領で研究員を1名募集いたしております。

ご興味のある方は是非、ご応募下さい。

また、近くに適任者がいらっしゃいましたらご紹介頂ければ幸いです。

 

 

遺伝子組み換え技術をもった研究者又は技術者 1名

 

【応募資格】

下記の技術内容について研究経験を有する大学院修士課程を修了された方

又は学部卒で2年以上の実務経験を有する方

 

【技術内容】

遺伝子組み換え技術一般、分子生物学、植物生化学、生化学、植物又は微生物の遺伝子解析、

バイオインフォマティクス、代謝工学、タンパク質工学、発酵工学

上記分野で、英語文献を基に通常の実験が追試できる技術レベル

 

【仕事内容】

発現ベクター構築(大腸菌、酵母)

遺伝子組み換え植物作成

変異酵素作成

 

【勤務地】

愛知県豊田市

 

【就業時期】

平成22年4月1日〜

 

【給与待遇】

経験・スキルを考慮の上、当社規定により決定

 

【選考方法】

書類審査・面接

 

【応募方法】

ご興味をお持ちになられましたら、まずはお電話・メールにてご連絡下さい。

 

株式会社トラスト・テック 豊田営業所

TEL:0565-36-0169

e-mail:saiyo [at] trust-tech.jp

人事採用担当 松藤(まつとう)宛

 

【弊社ホームページ】

URL  http://www.trust-tech.jp  

キーワード: recruit

投稿者: komaki @ 植物研究者人材募集 | 0 コメント

[nazuna 04472] 植物生理学会・データベース講習会のお知らせ

10.3.10 4:29 PMより転載

 

植物生理学会(熊本大)でのデータベース講習会についてお知らせいたします。

 

最後の総合討論では、DDBJの神沼さんによる,次世代シークエンサデータの登録・解析の追加講習を予定 しております。

 

また、以下、ご注意ください。

・あらかじめ、

PCの充電

をお願いいたします。

 

・当日、入り口にて、無線LAN接続のための申請用紙をお渡しいたします。

用紙は回収いたしますので、ご協力お願いいたします。

・開始前にネット接続作業が必要になりますので、余裕を持ってお越しください。

・真野先生の講習では、PCにQuickTime Player がインストールされている必要があります。

 

以上、どうぞよろしくお願いいたします。

 

矢野健太郎@明治大学

大林 武@東北大学大学院

 

-------------------------

●植物生理学会・データベース講習会

 

3 月18 日(木) 13:00 〜 16:40 X 会場

オーガナイザー 矢野健太郎(明治大・農)

大林  武(東北大学大学院・情報科学)

 

13:00 はじめに 矢野健太郎

<座長:大林 武>

13:10 S01-1 遺伝子発現データと機能アノテーションの活用法

      濱田和輝,鈴木絢子,矢野健太郎(明治大・農)

13:50 S01-2 ミヤコグサの栽培とゲノム情報におけるデータベースの利用法

      橋口正嗣,田中秀典,明石 良(宮崎大・フロンティア)

14:30 休憩(10分間)

<座長:矢野健太郎>

14:40 S01-3 百聞は一見にしかず—植物オルガネラ研究における画像データベースの構築とその利用—

       真野昌二1,2,三輪朋樹3,西川周一4,三村徹郎5,西村幹夫1,2

     (1基生研・細胞生物,2総合研究大学院大学・生命科学,3基生研・電算機室,

       4名大・院・理,5神戸大・院・理)

15:20 S01-4 ウィキを基盤とした植物情報リソース

      有田正規1,2,3(1東大新領域,2理研PSC,3慶大先端生命研)

15:50 総合討論

      次世代シークエンサデータのアーカイブ登録と解析パイプライン

      神沼英里,望月孝子,児玉悠一,猿橋智,菅原秀明,高木利久,大久保公策,中村保一(遺伝研DDBJ)

 

キーワード: event

投稿者: komaki @ 植物研究イヴェント案内 | 0 コメント

[nazuna 04469] セミナーの御案内 (3 月 15 日 )Dr. Dierk Wanke

 10.3.9 7:50 PMより転載

 

2010年3月15日(月) 10:00-12:00 東京理科大学 野田キャンパス 講義棟K209 (第1部

と第2部との間に小休憩を予定)

講師: Dr. Dierk Wanke (ドイツ・チュービンゲン大学 ZMBP - Pflanzenphysiologie)

http://www.zmbp.uni-tuebingen.de/plant-physiology/research-groups/harter

ke.html

 

第1部 "Novel approaches to unravel cellular signalling processes in plants"

 

The examination of signaling cascades in the inside of cells can only be

approximated by combining analyses on expression, interaction, modification

and localization in vivo and in vitro. Therefore, one of the most

challenging issues in biology and medicine is the acquisition of

quantitative data of subcellular processes at high spatio-temporal

resolution in living cells in their native tissue environment.

We established several methods to improve the current standards in

molecular biology: On the one hand, this is done by automated analysis of in

vivo imaging, the enhancement of imaging technology to reduce background and

complex correlation of fluorescence life time imaging data. On the other

hand, improvements in the analysis of large scale micro array expression

experiments and derived regulatory networks have enhanced our understanding

of cellular processes with spatio-temporal resolution.

While most of our knowledge has been tested on the AtGenExpress

resource information with Arabidopsis as a model organism, we extended our

experiences to large scale microarray expression and metabolite experiments

in barley, a moderate climate model organism for Poaceae. Simultaneous

sampling of grain tissues for analysis on expression and metabolite contents

enabled us to correlate metabolite patterns with gene expression

trajectories. Thus, we were able to identify several hundred candidate genes

that are possibly regulated by metabolite availabilities. Moreover,

exhaustive metadata analysis allowed us to compute a picture of gene

regulatory networks for the developing barley grain.

 

第2部 "Functional analysis of the plant transcription factors: Examples from

the BBR/BPC-family of GAGA-motif binding proteins"

 

The analysis of transcription factors (TFs) and their binding to

cis-regulatory DNA-motifs (CREs) is still challenging and crucial for the

understanding of the information flow within a cell. Qualitative data on

TF-CRE-interaction is lacking for more than 90 % of all eukaryote TFs.

Especially, the analysis of so far uncharacterized TFs harbors the highest

information content and might lead to entirely novel insights.

BBR/BPC proteins comprise a class of transcription factors that are

uncharacterized and confined to the plant kingdom. They have been identified

due to their specific binding to a conserved simple di-nucleotide sequence

repeat DNA-element (GA/TC)n.

The BBR/BPC family can be subdivided into distinct groups by

phylogenetic analysis on their conserved DNA-binding domain sequence. These

genes exhibit group-wise expression patterns that are indicative of a high

degree of functional redundancy between the group members.

Group II proteins form homo-/hetero-oligomeric structures in the

nucleus and the nucleolus, which are mediated by a novel type of coiled

coil-interaction domain. Target site analyses of putative binding motifs

suggest a role for BBR/BPC proteins in regulating other transcription factor

or hormone signalling related genes. Moreover, we provide indications that

BBR/BPC proteins are contained in higher order complexes with other

proteins, and that these are important for the correct localization of

BBR/BPCs to the nucleolus.

 

東京理科大学野田キャンパスは、東武野田線運河駅(つくばエクスプレス・流山おお

たかの森駅から7分)下車徒歩5分です。

http://www.tus.ac.jp/info/access/nodcamp.html

 

興味をお持ちの方の御来聴を歓迎致します。

 

------------------------------------

朽津 和幸 (Prof. Dr. Kazuyuki KUCHITSU) 

キーワード: event

投稿者: komaki @ 植物研究イヴェント案内 | 0 コメント

[nazuna 04465] セミナーのお知らせ( 3 月 25 日)

10.3.8 6:46 PMより転載

 

産業技術総合研究所 ゲノムファクトリー研究部門 遺伝子転写制御研究グループ(グループリーダー:高木優)では、

このたび米国オハイオ州立大学の武田隆太氏(Prof. Biao Ding lab所属)をお迎えしてセミナーをしていただくことになりました。

武田氏は、植物病原体RNAのウイロイドをモデルに用いて、RNA細胞間移動に必要なRNA構造モチーフとその詳細な機能を研究していらっしゃいます。

興味がおありの方はぜひご参集下さい。

 

日時:3月25日(木)14:00-15:00

場所:(独)産業技術総合研究所 つくば中央第4事業所 4-1棟3階AV室

 

タイトル:

Loop 6 and loop 19 of Potato spindle tuber viroid:

Essential RNA structural motifs regulating RNA inter-cellular trafficking

 

要旨:

The mechanism how an RNA itself directly regulates its trafficking between cells remains poorly understood, though the importance of inter-cellular RNA trafficking has been well-established based on the studies on both endogenous and infectious RNAs in different organisms. Viroids, small but highly structured non-coding RNA pathogens, are excellent models to investigate the molecular mechanism of RNA trafficking. Using Potato spindle tuber viroid (PSTVd) infection of Nicotiana benthamiana as the experimental system, we demonstrated that the various RNA loop structures, consisting of non-Watson-Crick base pairs, were essential for PSTVd systemic trafficking. The role of loop 6 and loop 19 in regulating inter-cellular RNA trafficking will be presented. For loop 6, the tertiary structural model was inferred by the comparisons with the X-ray crystal structures of the similar motifs in other RNAs. Extensive mutational analyses showed that the 3D structure of loop 6 is required fo!

 r PSTVd trafficking. Cellular analyses revealed that the maintenance of the tertiary structure of loop 6 is essential for PSTVd to traffic between specific cell types. Our findings support the hypothesis that unique RNA structural motifs mediate trafficking across distinct cellular layers. Furthermore, our approaches should be useful in characterizing the structure-function relationships for other RNA motifs.

 

弊所の地図は下記にございます。

http://www.aist.go.jp/aist_j/guidemap/pdf/info_desk.pdf

地図中の中央第四と書かれたエリアの4-1棟になります。お手数ですが受付で訪問者証をお受け取り下さい。

 

よろしくお願いいたします。

 

藤原

 

キーワード: event

投稿者: komaki @ 植物研究イヴェント案内 | 0 コメント

[nazuna 04463] 国際植物窒素同化代謝会議(  Nitrogen 2010 )のお知らせ2(参加登録& Abstract 受付中)

10.3.5 10:30 AMより転載

 

国際植物窒素同化代謝会議(Nitrogen 2010)のお知らせ

 

 2010年7月に愛知県犬山市において国際植物窒素同化代謝会議(Nitrogen 2010)が開催されます。本会議は、植物の窒素同化や代謝に関する国際会議で、今回初めて日本で開催されるものです。窒素吸収と同化、情報伝達、システムズバイオロジー、他の代謝系との相互作用、生態学など多様なトピックスを取り上げ、150名を越える国内外からの参加者を予定しております。興味のお持ちの方は是非ご参加ください。現在、参加登録と講演要旨の受付を行なっております。下記のホームページをご覧になり、お申し込みください。

 

講演要旨登録締め切り:

2010年3月末

 

参加登録締め切り:

2010年4月末

 

ただし、講演要旨を登録する方は事前に参加登録をお済ませください。

 

 

 

日時:2010年7月26日〜30日

 

場所:犬山国際観光センター フロイデ(愛知県犬山市松本町)

 

ホームページ:http://www.agri.tohoku.ac.jp/cellbio/nitrogen2010/nitrogen2010.htm

 

 

 

組織委員会

 

委員長:山谷知行(東北大)

 

委員:小俣達男(名大)、小島創一(東北大)、斉藤和季(千葉大)、榊原均(理研)、白石斉聖(神戸大)、末吉邦(新潟大)、高橋秀樹(理研)、長谷俊治(阪大)、長谷川博(滋賀県立大)、早川俊彦(東北大)、藤原徹(東大)

 

 

キーワード: event

投稿者: komaki @ 植物研究イヴェント案内 | 0 コメント

[nazuna 04467] 第 12 回植物オルガネラワークショップのお知らせ

10.3.9 4:39 PMより転載

 

開催日が迫ってきましたので,再度案内させて頂きます.当日参加も大歓迎です.

 

-----

 第12回植物オルガネラワークショップを3月17日(水)の午後に、第51回日本植物年理学会年会のサテライトとして、熊本市民会館で開催します。ワークショップへの参加は無料です。また、ミキサーの参加費は 3,500円(予定)で、当日会場にて徴収します。ワークショップおよびミキサーへの参加希望者は3月8日(月)までに次のホームページよりお申し込み下さい。当日参加も歓迎します。

 

オルガネラワークショップホームページ

http://sfns.u-shizuoka-ken.ac.jp/pctech/workshop

 

連絡先:  高野博嘉(熊本大学 理学部)

  E-mail: takanohiroyoshi [at] gmail.com 

       TEL: 096-342-3432

 

******************************************

第12回植物オルガネラワークショップ 

「ゲノム時代の植物オルガネラ研究」

 

世話人(あいうえお順):

 小保方潤一、河野重行、楠見健介、小林裕和、坂本亘、鹿内利治、高野博嘉

日時:2010年3月17日(水)14:00~18:45

会場:熊本市民会館(崇城大学市民ホール)

http://www.city.kumamoto.kumamoto.jp/content/web/asp/kiji_detail.asp?ID=4119

 

14:00 開会、世話人挨拶

 

セッション1:オルガネラ分化の分子基盤(14:05-15:35)

 

14:05〜14:35

「シロイヌナズナ葯タペータム内の特異な脂質系オルガネラの分化」

永田典子(日本女子大・理)

 

14:35〜15:05

「オルガネラ遺伝子発現を支えるPPRタンパク質、その分子基盤」

中村崇裕 (九大院・農、JSTさきがけ)

 

15:05〜15:35

「葉緑体形成異常を示すalbino or pale-green (apg)変異体の機能解析」

明賀史純1、本橋令子2、篠崎一雄1 (1理化学研究所植物科学研究センター、2静岡大学)

 

 

15:35〜15:50 休憩

 

セッション2: ゲノム情報とオルガネラ機能 (15:50-17:20)

 

15:50〜16:20

「ゲノム情報とプロテオミクスを基盤にした色素体・ミトコンドリア分裂機構の解析」

吉田大和1、黒岩晴子1、河野重行2、黒岩常祥1

(1立教大・極限生命情報研究センター、2東京大・新領域・先端生命)

 

16:20〜16:50

「バイオインフォマティクスを利用した光合成研究」

高林厚史(北海道大学・低温科学研究所)

 

16:50〜17:20 

「Structure and biogenesis of the chloroplast NAD(P)H dehydrogenase complex」

Lianwei Peng1, Yoichiro Fukao2, Toshiharu Shikanai1

(1Graduate School of Science, Kyoto University, 2Graduate School of Biological Sciences, Nara Institute of Science and Technology)

 

17:20〜17:35 休憩

 

17:35〜18:35 特別講演

「植物色素アントシアンー研究の歴史と今後の方向ー」 

       吉玉国二郎 (熊本大・院・自然科学)

 

18:35 総合討論

18:45 閉会

 

19:00~21:00 ミキサー  熊本市民会館内 「勧業館」

******************************************

 

高野博嘉(熊本大学 理学部) 

キーワード: event

投稿者: komaki @ 植物研究イヴェント案内 | 0 コメント

March 04, 2010

[bioinformatics-jp] 特任研究員公募:新学術領域: 初期胚細胞動態のインシリコ再構成技術と数理モデルの構築

 10.3.3 3:53 PMより転載

 

 新学術領域研究「初期胚細胞動態のインシリコ再構成技術と数理モデルの構築」におきまして、

下記の内容で1名公募しておりました特任研究員(ポスドク)の公募期間を延長いたしました。

 

詳細な募集内容は

http://research.crmind.net/2010/02/2010-2-cellcom.php

に掲載しておりますのでまずはこちらをご参照ください。

 

具体的な研究としましては、バイオイメージング画像から定量的な特性を抽出してくる画像解析法の開発および

抽出できたデータの解析方法の開発に中心的に携わってくださる方を募集しております。

 

この分野はバイオインフォマティクスの1分野として今後大きな発展が期待される分野であり、

本研究では新学術領域研究の他の計画班らからマウス初期発生などに関わる様々なデータを提供していただけることになっております。

 

コンピュータープログラミングの技術がありデータ解析に積極的にコミットしてくださる方であれば、

必ずしも画像解析に関する経験などは求めません。

逆にこちらの画像解析のツールや知識などで積極的にバックアップいたします。

実際のデータから始めて発生現象の法則を導く研究に興味のあるかたがいらっしゃればぜひご応募ください。

また、このような研究に興味を持ちそうな方をもしご存知でしたら、ぜひ下記を転送していただけると幸いです。

 

よろしくお願いいたします。

 

【公募概要】(公募ページで必ず最新の情報をご確認ください)

# 職種:特任研究員

# 募集人員:1名

# 職務内容:新学術領域 研究「初期胚細胞動態のインシリコ再構成技術と数理モデルの構築」の目的に沿った研究への参加

# 公募対象:公募ページ参照

# 雇用期間:平成22年4月15日以降のできるだけ早い時期から平成23年3月31日

  * ただし 新学術領域研究の終了(最長で平成27年3月末日)までの更新可能性有り

# 勤務地:東京大学生産技術研究所

# 処遇:特任研究員として、東京大学の規定に準じ支給する

# 勤務時間:専門業務型採用労働制(1日8時間、週40時間相当)、その他東京大学の規定に準ずる。

# 応募期間:平成22年3月31日まで

# 選考方法:到着した書類の中から随時選考を行う。適任者が見つかればその時点で応募を打ち切る。決まらない場合は採用者が決定するまでの間公募を続ける予定。

  * 公募の現況は http://research.crmind.net に随時掲載。また、必要に応じて面接などをすることがあります。

# 問い合わせ先:tetsuya[at]mail.crmind.net ([at]を@で置き換えてください)

  * 直接,電話での問い合わせを希望する場合は,まずメールでの連絡をお願いいたします.

#応募方法:公募ページ参照

 

【 公募ページ】http://research.crmind.net/2010/02/2010-2-cellcom.php

 

 

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小林 徹也(Tetsuya J. Kobayashi) 

キーワード: recruit

投稿者: komaki @ 植物研究者人材募集 | 0 コメント

遺伝研DDBJの神沼です。

「DDBJオープンシステムプロジェクト」公募の御案内をさせて頂きます。

前回は多数の御応募をありがとうございました。

今期も継続致しますので、皆様の積極的な御応募をお待ちしております。

 

====================================================================

平成22年度上期DDBJオープンシステムプロジェクトの募集について

 

URL: http://www.ddbj.nig.ac.jp/whatsnew/2010/100301-j.html

E-mail: opensystem [at] ddbj.nig.ac.jp

--------------------------------------------------------------------

1.プロジェクトの概要

日本DNAデータバンク(DDBJ)が所有する大規模計算機環境

「解析サーバ PCクラスタ(ホスト名 an200)」を,データ解析,シミュレーション,

バイオ関連のプログラム開発,高速化に関する試用等のために所内外の研究者に

無償で提供する。

 

2.研究プロジェクトの対象

最大48ノード(192コア)を使用する大規模計算を大量に行う研究

(上記ノード内での分割提供も可能)

 

3.応募資格

申込者(代表者)は「国内の大学に所属する研究者,公共機関に所属

する研究者」とし,研究グループのメンバーは,情報・システム研究機構

国立遺伝学研究所 DDBJ塩基配列データベース等利用規約に順ずる以下の

有資格者

  ・国内の大学に所属する学生・研究者

  ・公共機関に所属する研究者

  ・企業に所属する研究者,技術者

 

情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所DDBJ塩基配列データベース等利用規規約

  (http://www.ddbj.nig.ac.jp/ddbjing/nigapply/rule_doc-j.html

 

 

4.研究期間

   平成22年4月15日〜平成22年9月30日の間

    (10月以降についても同様の募集を予定。詳細については改めて公表)

 

5.応募締切 

 

   平成22年3月19日(金)(必着)

 

6.審査方法

   ・応募課題は,DDBJにより採否を審査し,結果の公表を行う予定

 

   ・平成22年3月31日(水)(予定)までに採否を申込者(代表者)にご連絡致します。

 

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神沼英里 Eli Kaminuma, Ph.D.

キーワード: recruit

投稿者: komaki @ 植物研究者人材募集 | 0 コメント

[bioinformatics-jp] GCOE公開シンポジウム開催のお知らせ

10.3.3 2:25 PMより転載

 

 

GCOE公開シンポジウム開催のお知らせ

 

東京大学グローバルCOE「ゲノム情報ビッグバンから読み解く生命圏」公開シ

ンポジウムを下記の通り開催いたします。参加を希望される方は事前登録をして

いただきますようお願いいたします。多数のご参加をお待ちしております。

参加登録のページ  http://www.cb.k.u-tokyo.ac.jp/gcoe/registration

 

日時: 平成22年4月10日(土)10:00〜13:00

会場: 東京大学小柴ホール(〒113-8654 文京区本郷7-3-1 東京大学理学部1

号館中央棟2階)

 

−プログラム−

 

10時00分〜10時05分 ●ご挨拶

10時05分〜10時25分 ●「パーソナルゲノム解読とスーパーコンピューティング」

森下 真一(東京大学 大学院新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻)

 

10時25分〜10時45分 ●「大規模データ解析のための高性能並列システム環境構

築に向けて」

石川 裕(東京大学 大学院情報理工系研究科 コンピュータ科学専攻、東京大学

情報基盤センター)

 

10時45分〜11時05分 ●「次世代シークエンサーを利用したトランスクリプトー

ム解析」

菅野 純夫(東京大学 大学院新領域創成科学研究科 メディカルゲノム専攻)

 

11時05分〜11時35分 ●招待講演「次世代シークエンサーによる染色体構造のプ

ロファイリング」

白髭 克彦(東京大学 分子細胞生物学研究所)

 

11時35分〜11時55分 ●「大規模シミュレーションと生命科学」

泰地 真弘人(理化学研究所 基幹研究所 システム生物学研究グループ)

 

11時55分〜12時15分 ●「腸内に常在する細菌叢のメタゲノム科学」

服部 正平(東京大学 大学院新領域創成科学研究科 オーミクス情報センター)

 

12時15分〜12時45分 ●招待講演「ゲノム情報ビッグバンから読み解く生命の時間」

上田 泰己(理化学研究所 発生再生科学総合研究センターシステムバイオロジー

研究プロジェクト)

 

12時45分〜13時00分 ●総合討論

 

追記:シンポジウム終了後、新領域創成科学研究科3専攻(先端生命科学専攻、

メディカルゲノム専攻、情報生命科学専攻)の合同入試説明会を開催します。

 

【お問い合わせ先】

東京大学大学院新領域創成科学研究科

GCOE「ゲノム情報ビッグバンから読み解く生命圏」事務局

TEL: 04-7136-3980 FAX: 04-7136-3974  E-mail: gcoe [at] cb.k.u-tokyo.ac.jp

 

-----------------------------------

 

三浦史仁

 

東京大学大学院 理学系研究科

生物化学専攻 伊藤隆司研究室 

キーワード: event

投稿者: komaki @ 植物研究イヴェント案内 | 0 コメント

[nazuna 04460] Noni Franklin-Tong 教授 ( 英国・バーミンガム大学) セミナーの御案内

10.3.2 4:28 PMより転載 

 

東京理科大学野田キャンパスにおいて、植物の受精における自己非自己の認識(自家

不和合性)のシグナル伝達機構研究で著名な、Franklin-Tong教授によるセミナーを開

催致します。学生や専門外の方にわかりやすいように、入門的な部分から丁寧に講演

される予定です。興味をお持ちの方の御参加をお待ち致しております。

 

セミナー1:  2010年3月8日(月) 10:00-11:30 東京理科大学野田キャンパス 計算

科学研究センター4階大会議室

Self-incompatibility signalling networks:conversations that tell “self”

pollen to commit suicide

 

Higher plants produce seed through pollination, using specific interactions

between pollen and pistil to control of pollination at many levels.

Self-Incompatibility (SI) is an important mechanism to prevent inbreeding

and ensures that genetic diversity is maintained. This system presents a

fascinating example of a cell-cell recognition and rejection system in

plants, controlled by a multi-allelic S locus. “Self” (incompatible)

pollen is discriminated from “non-self” (compatible) pollen, by

interaction of pollen and pistil S locus components, and is subsequently

inhibited. We are studying SI in Papaver rhoeas, which uses a

“receptor-ligand” system to trigger Ca2+-dependent signalling. This

interacts with many cellular components that are harnessed into a complex

network to ensure “self” pollen inhibition and eventually programmed cell

death, which is similar to apoptosis. This provides a very neat way to get

rid of unwanted “self” pollen and prevent self-fertilization. I will

provide an overview of this topic.

 

セミナー2:  2010年3月9日(火) 10:00-11:30 東京理科大学 野田キャンパス 計

算科学研究センター4階大会議室

Recognition of "self" can be deadly: receptor-ligand interactions and

signalling networks that trigger programmed cell death in pollen

 

Self-incompatibility (SI) is an important mechanism used by many higher

plant species to prevent inbreeding. It is controlled by a multi-allelic S

locus that allows discrimination between “self” (incompatible) pollen from

“non-self” (compatible) pollen, which is allowed to fertilize the plant by

interaction of pollen and pistil S locus components. In Papaver rhoeas, the

pistil S determinant (recently renamed as PrsS, Papaver rhoeas stigma S) is

a small novel protein that acts as a signalling ligand. It interacts with

its cognate pollen S-determinant (Papaver rhoeas pollen S), PrpS. PrpS is

specifically expressed in pollen, is linked to the pistil S gene, and

displays the high polymorphism expected of an S locus determinant. It

encodes a novel ~20 kDa transmembrane protein with no homology to proteins

in existing databases. PrpS was recently shown to be functionally involved

in SI. Identification of PrpS as the Papaver pollen S-determinant strongly

supports the hypothesis that Papaver SI is triggered by a receptor-ligand

interaction. This was originally based on the finding that when PrsS

interacts with incompatible pollen, it triggers increases in cytosolic free

Ca2+. We have recently begun to use electrophysiology to characterize the

currents activated by SI, and speculate that PrpS may function as a channel

or pore protein.

      Ultimately, and probably the major target for SI signals is initiation

of programmed cell death (PCD) involving several caspase-like activities in

incompatible pollen. This provides a very neat way to get rid of unwanted

“self”  pollen and prevent self-fertilization. I will talk about the

Ca2+-dependent signalling network, and its targets and how we currently

think it is integrated. The actin cytoskeleton seems to be centrally

involved in integrating or signalling to PCD and I will discuss new data

from our SI system relating to this, suggesting polymerization of actin may

be important; analysis of actin-binding proteins that mediate this stage may

provide clues to the story. I will also present unpublished data on reactive

oxygen species (ROS) and nitric oxide (NO) signalling triggered by the SI

response. Recent work has shown that SI-induced caspase-like proteins, such

as DEVDase, have a very narrow acidic pH optimum, which suggests SI might

trigger dramatic changes in the cytosolic pH. We have investigated whether

acidification of the cytosol may be due to disruption of organelles, and I

will present data showing that the vacuolar compartments of SI-induced

pollen tubes undergo reorganization and disintegrate. This SI-induced

disruption could potentially generate the optimal acidic pH for caspase-like

activities which results in PCD in incompatible pollen tubes.

 

References

Thomas SG, Franklin-Tong VE. (2004). Self-incompatibility triggers

programmed cell death in Papaver pollen. Nature 2004; 429: 305-309.

Thomas SG, Huang S, Li S, Staiger CJ, Franklin-Tong VE. (2006) Actin

depolymerization is sufficient to induce programmed cell death in

self-incompatible pollen. J Cell Biol 174: 221-229.

Bosch M, Franklin-Tong VE. (2007) Temporal and spatial activation of

caspase-like enzymes induced by self-incompatibility in Papaver pollen. PNAS

USA 104: 18327-18332.

de Graaf BHJ, Rudd JJ, Wheeler MJ, Perry RM, Bell EM, Osman K, et al. (2006)

Self-incompatibility in Papaver targets soluble inorganic pyrophosphatases

in pollen. Nature 444: 490-493.

Wheeler MJ, de Graaf BHJ, Hadjiosif N, Perry RM, Poulter NS, Osman K, et al.

(2009) Identification of the pollen self-incompatibility determinant in

P.rhoeas. Nature 459: 992-995.

Poulter NS, Staiger CJ, Rappoport JZ, Franklin-Tong VE. (2010) Actin-binding

proteins implicated in formation of the punctate actin foci stimulated by

the self-incompatibility response in Papaver. Plant Physiol January 15,

2010: pp.109.152066.

 

東京理科大学野田キャンパスは、東武野田線運河駅(つくばエクスプレス・流山おお

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朽津 和幸 (Prof. Dr. Kazuyuki KUCHITSU) 

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